Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERVK_113P63132 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms