Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UFM1P61960 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UFM1P61960 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UFM1P61960 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms