Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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