Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
H2BFSP57053 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms