Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRKAA2P54646 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRKAA2P54646 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms