Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA3P52797 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms