Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP153P49790 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP153P49790 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP153P49790 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP153P49790 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms