Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CSNK1EP49674 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1EP49674 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms