Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FNTBP49356 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FNTBP49356 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms