Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FNTAP49354 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms