Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFX3P48380 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFX3P48380 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms