Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ACVR1BP36896 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ACVR1BP36896 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms