Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CHRNA7P36544 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms