Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP5C1P36542 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms