Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPC1P35052 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPC1P35052 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GPC1P35052 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms