Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
OTX2P32243 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms