Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PSMB4P28070 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms