Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PTX3P26022 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PTX3P26022 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms