Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5A1P25705 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5A1P25705 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5A1P25705 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5A1P25705 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5A1P25705 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP5A1P25705 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms