Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NR4A1P22736 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms