Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms