Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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HOXA5P20719 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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