Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATP4AP20648 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms