Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SPI1P17947 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SPI1P17947 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SPI1P17947 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SPI1P17947 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPI1P17947 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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