Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNA6P17658 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms