Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms