Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMIGD3P0DMS9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMIGD3P0DMS9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms