Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THY1P04216 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THY1P04216 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THY1P04216 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THY1P04216 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THY1P04216 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THY1P04216 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THY1P04216 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms