Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NIPSNAP2O75323 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms