Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms