Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SETD1AO15047 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms