Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EBAG9O00559 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms