Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CENPBD1B2RD01 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms