Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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