Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SOBPA7XYQ1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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