Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F8A0AVK6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms