Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SNX13Q9Y5W8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms