Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RGL4-209ENST00000612432 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CHTOPQ9Y3Y2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms