Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IFT52Q9Y366 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IFT52Q9Y366 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms