Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ERVW-1Q9UQF0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms