Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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FOXD3Q9UJU5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXD3Q9UJU5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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