Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHORDC1Q9UHD1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms