Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CHRNA9Q9UGM1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA9Q9UGM1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms