Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COPS7AQ9UBW8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPS7AQ9UBW8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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