Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM8A1Q9UBU6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms