Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGSF9Q9P2J2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGSF9Q9P2J2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms