Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EHD3Q9NZN3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EHD3Q9NZN3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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