Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NECTIN3Q9NQS3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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