Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL1RAPQ9NPH3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms