Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRIM4Q9C037 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms